Добрый. Вы пишете "за счет замены грм на 12". Вы поставили 12 ГРМ в сборе?
Прошивка ни при чем. Многие ездят без замены прошивки вообще. И, поверьте, у них нет таких проблем. Проверьте - как открывается дроссельная заслонка - на все 100% ? Нет ли подсоса воздуха. Меняли ли вы уплотнительные кольца впускного ресивера?
С уважением, Александр.